update

src/atividades/visao/pesquisa4/ClustalW-descricao.tmpl → src/atividades/visao/pesquisa4/Clustal-descricao.tmpl

@@ -6,7 +6,7 @@
 #def content
 <div id="content" class="activity">
 <a name="top"></a>
-$Util.heading(u"Descrição dos resultados do ClustalW:")
+$Util.heading(u"Descrição dos resultados do Clustal:")
 <ul>
 		<li>No alinhamento os caracteres <strong>' * '</strong>,  <strong>' : '</strong>  e <strong>' . '</strong> indicam:
 				</li>

src/atividades/visao/pesquisa4/exercicio4.tmpl

@@ -11,28 +11,28 @@ $Menu.exercises("visao", selected="4")
 
 $Util.sections(exercise="4", selected="2")
 
-$Util.heading(u"Como identificar regiões conservadas entre proteínas (ClustalW)?")
+$Util.heading(u"Como identificar regiões conservadas entre proteínas (Clustal)?")
 <div class="textbox">
 <ul>
 		<li>Neste exercício vai comparar as opsinas humanas responsáveis pela captação da luz vermelha (OPSR), verde (OPSG), azul (OPSB) e da visibilidade  no escuro (OPSD).
  				</li>
-		<li>O programa ClustalW permite alinhar as respectivas sequências de aminoácidos e identificar regiões conservadas, ou seja, aminoácidos iguais ou semelhantes entre as quatro proteínas.
+		<li>O programa Clustal permite alinhar as respectivas sequências de aminoácidos e identificar regiões conservadas, ou seja, aminoácidos iguais ou semelhantes entre as quatro proteínas.
 				</li>
 	</ul>	
 </div>
 
 <ul class="icon">
-		<li class="research">Entre no programa <a href="http://www.ebi.ac.uk/clustalw/" target="_blank">ClustalW</a> do EBI <sup><span title=" European Bioinformatics Institute - centro de investigação e de serviços em bioinformática, faz parte do European Molecular
+		<li class="research">Entre no programa <a href="http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/" target="_blank">Clustal</a> do EBI <sup><span title=" European Bioinformatics Institute - centro de investigação e de serviços em bioinformática, faz parte do European Molecular
 		Biology Laboratory (EMBL), Hinxton, Inglaterra"> [1]</span></sup>
 				</li>
-  		<li class="research">Copie as quatro <a href="/media/txt/pesquisa4/opsinas-humanas.txt" target="_blank">sequências de aminoácidos</a> para a janela do ClustalW.
+  		<li class="research">Copie as quatro <a href="/media/txt/pesquisa4/opsinas-humanas.txt" target="_blank">sequências de aminoácidos</a> para a janela do Clustal.
   				</li>
   		<li class="research">Clique em <strong>Submit</strong>
   				</li>
 	</ul>
 <center>
 	<h4>	
-			<p><i>Seja paciente pois o ClustalW leva algum tempo a alinhar as sequências!</i></p>
+			<p><i>Seja paciente pois o Clustal leva algum tempo a alinhar as sequências!</i></p>
 			<p><i>O resultado do alinhamento pode ser visualizado a cores se clicar em <strong>Show colors</strong></i></p>
 				</h4>
 </center> 
@@ -41,7 +41,7 @@ $Util.heading(u"Como identificar regiões conservadas entre proteínas (ClustalW
   		<li class="question">No alinhamento, os caracteres (<strong>*</strong>), (<strong>:</strong>) e (<strong>.</strong>), indicam a 
   		semelhança encontrada entre as quatro proteínas. Observa alguma relação entre os aminoácidos das colunas e cada um deste caracteres?
   				</li>
-  		<li class="indent">Dica:<i>Consulte a <a href="ClustalW-descricao.html" target="_blank">descrição do ClustalW</a>.</i>
+  		<li class="indent">Dica:<i>Consulte a <a href="Clustal-descricao.html" target="_blank">descrição do Clustal</a>.</i>
 				</li>
   		<li class="question">Acha que consegue identificar zonas com diferentes graus de semelhança ao longo do alinhamento?
   				</li>

src/atividades/visao/pesquisa4/intro4.tmpl

@@ -20,7 +20,7 @@ $Util.heading(u"O QUE HÁ DE SEMELHANTE ENTRE AS OPSINAS?")
 			</li>
    	<li>Este tipo de análises são de extrema importância pois existe um relacionamento entre a estrutura das proteínas e a sua função.
 			</li>
-  	<li>Existem vários métodos para fazer os alinhamentos e o mais utilizado é o ClustalW.
+  	<li>Existem vários métodos para fazer os alinhamentos e o mais utilizado é o Clustal.
 			</li>
   	<li>Na primeira parte deste exercício propomos que identifique os aminoácidos conservados entre opsinas humanas e que os relacione com a respectiva função. Na segunda parte do exercício vai observar a estrutura 3D das opsinas.
 			</li>